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真核轉(zhuǎn)錄組測序
主要針對轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物mRNA進(jìn)行高通量測序,可快速獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態(tài)下的基因表達(dá)量及結(jié)構(gòu)變異等,可用于差異表達(dá)分析、挖掘功能基因、RNA編輯分析等。目前已廣泛應(yīng)用于生物學(xué)研究、農(nóng)業(yè)、醫(yī)學(xué)等多個領(lǐng)域,揭示生物生長發(fā)育調(diào)控機(jī)制、不同環(huán)境適應(yīng)機(jī)制、作物優(yōu)良形成機(jī)理、疾病發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)理等。
應(yīng)用領(lǐng)域:
樣本全轉(zhuǎn)錄本信息獲取、基因注釋及篩選、基因結(jié)構(gòu)分析
產(chǎn)品優(yōu)勢:
1、準(zhǔn)確的數(shù)字化信號,專業(yè)的檢測通量,廣泛的檢測范圍
2、富涵7大功能注釋數(shù)據(jù)庫,準(zhǔn)確描述基因功能
3、建立差異表達(dá)分析,有效挖掘功能基因
4、專業(yè)的定制化信息分析服務(wù)
標(biāo)準(zhǔn)信息分析
1、測序數(shù)據(jù)及其質(zhì)量控制
2、轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)組裝
3、轉(zhuǎn)錄組文庫質(zhì)量評估
4、Unigene功能注釋
5、基因結(jié)構(gòu)分析:CDS預(yù)測、SSR分析、SNP分析
6、基因表達(dá)量分析:Unigene表達(dá)量計算、不同樣品總體表達(dá)量比對
7、差異表達(dá)分析: 重復(fù)相關(guān)性評估、差異表達(dá)基因篩選、差異表達(dá)基因聚類分析
8、差異表達(dá)基因功能注釋和富集分析:差異表達(dá)基因GO功能富集、差異表達(dá)基因COG分類、差異表達(dá)基因KEGG注釋、差異表達(dá)基因KEGG通路富集分析
樣品要求:
1.樣品類型:總RNA;
2.樣品濃度:≥250 ng/ul;
3.樣品總量:>6ug(真核生物);>10ug(原核生物)
4.樣品純度: OD260/280為1.8~2.2,OD260/230≥1.0,260nm處有正常峰值。
5.RNA完整性: 電泳檢測28S/18S≥1.5。(距送樣日最近的電泳結(jié)果)
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