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      GST pull down

      GST pull down(GST融合蛋白沉降技術(shù))是體外檢測蛋白相互作用的常用方法,可驗(yàn)證已知蛋白之間的互作,也可用于篩選與已知蛋白互作的未知蛋白。此方法操作方便,簡單易行。


      GST pull down實(shí)驗(yàn)原理

      GST pull down的主要原理是利用DNA重組技術(shù)將已知蛋白與GST融合,而融合蛋白通過GST與固化在載體上的GTH(谷胱甘肽)親和結(jié)合。簡單來說,我們假定a蛋白和b蛋白可能存在互作,將純化的融合GST的a蛋白和純化的b蛋白以及能特異性結(jié)合GST的Sephrose 4B beads混合在一起孵育一定時(shí)間,然后洗去未結(jié)合的蛋白,煮沸beads進(jìn)行SDS-PAGE電泳。通過Western blot檢測結(jié)果,我們可以看到GST-a蛋白和b蛋白所對(duì)應(yīng)的條帶,即表明了a蛋白和b蛋白因發(fā)生相互作用而被GST-a pull down(GST對(duì)照只顯示一個(gè)條帶)。

      GST pull down實(shí)驗(yàn)步驟

      GST-a融合蛋白的制備

      1.GST-a融合蛋白的表達(dá)

      (1)將目的蛋白與GST的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到BL21菌株中;

      (2)挑取單克隆到含有5ml LB培養(yǎng)基(加入5ul氨芐)的10ml試管里,37℃恒溫振蕩培養(yǎng)箱中培養(yǎng)過夜;

      (3)將培養(yǎng)菌液轉(zhuǎn)移到含有500ml LB(含500ul氨芐)的1L錐形瓶中,37℃,200rpm培養(yǎng)數(shù)小時(shí);

      (4)測定OD600值,當(dāng)OD600達(dá)到0.6左右時(shí),加入適當(dāng)濃度的IPTG,在20℃,200rpm條件下培養(yǎng)10-16h(通常需要進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn)以確定較佳IPTG濃度、誘導(dǎo)溫度和時(shí)間);

      (5)誘導(dǎo)適當(dāng)時(shí)間后,將菌液分次倒入50ml離心管中,4℃ 4000rpm離心10分鐘,然后棄去上清,收集管底菌體,如暫時(shí)不用,可將菌體保存于-80℃冰箱中;

      (6)先加入少量PBS于離心管中,離心5-10min后棄去上清,再按每10ml菌液沉淀1ml PBS的量加入相應(yīng)的PBS,渦旋振蕩,使菌體沉淀充分溶解于PBS溶液中;

      (7)把混合菌體置于冰水浴中,用超聲儀進(jìn)行破碎。每次超聲破碎20s,間隔30s(破碎時(shí)間、破碎次數(shù)和間隔時(shí)間視具體情況而定),經(jīng)過適當(dāng)時(shí)間超聲后,溶液會(huì)顯得澄清;

      (8)將超聲后的溶液4℃ 4000rpm離心10分鐘,上清液轉(zhuǎn)移至新的離心管中,-80℃保存?zhèn)溆谩?


      2.GST-a融合蛋白的純化

      (1)在新鮮制備的裂解液上清中加入適量體積50% Glutathione Sepharose 4B,4℃搖床上緩慢搖動(dòng)30~60min;

      (2)4℃,4000rpm離心5min,棄去上清,該Sepharose上結(jié)合了GST-a融合蛋白;

      (3)加入200ul預(yù)冷的PBS溶液,輕晃懸浮珠子,將Sepharose洗滌一次,4℃,4000rpm離心5min,棄去上清,重復(fù)此步驟3次;

      (4)最后一次用移液槍吸走珠子表面的液體,但注意不要吸走珠子,即可獲得結(jié)合GST-a的Sepharose。


      b蛋白的制備

      b蛋白可融合His標(biāo)簽進(jìn)行原核表達(dá),也可融合Flag/HA/Myc等標(biāo)簽進(jìn)行真核表達(dá)。


      體外蛋白的結(jié)合

      (1)將結(jié)合有GST-a融合蛋白的Sepharose 4B懸浮在適量體積的緩沖液中,加入20ul含有b蛋白的溶液,同時(shí)采用結(jié)合有GST蛋白的Sepharose作為陰性對(duì)照,在搖床上晃動(dòng)4-8h(4℃);

      (2)4℃,4000rpm離心5min,棄去上清液;

      (3)沿壁加入200ul預(yù)冷的緩沖液對(duì)Sepharose進(jìn)行洗滌,

      (4)4℃,4000rpm離心5min,棄上清,該步驟重復(fù)3次;

      (5)吸干Sepharose上面的液體后,加入20ul 1×蛋白電泳上樣緩沖液,沸水浴5min,放入-20℃冰箱備用;

      (6)通過SDS-PAGE和Western blot進(jìn)行檢測。

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